隨著水產養殖業的發展，養殖業因病原微生物引起疾病時有發生，對養殖業危害極大。各養殖設施除加強管理外， 在飼育水及使用的各類器具上消除病原微生物已成為一個重要課題。臭氧作為一種強氧化劑、消毒劑、催化劑不僅在工業上得到廣泛的應用，實踐證明臭氧亦在水消毒、改善水質、防止水產養殖系統內的疾病及赤潮解毒等領域得到了成功的應用。通過臭氧殺菌裝置可對生物卵消毒、養殖水殺菌、設施消毒，可以防止病原體的侵入。臭氧具有強烈的殺菌消毒和水質凈化作用，而且無毒無害，是水產養殖和育苗生產中最理想的殺菌凈化劑，對防治魚、蝦、海膽、河蟹、甲魚等生物病害，改善水產養殖的生態環境，有著重要的意義。 總之水產養殖中使用臭氧育苗，現在成套的設備價格并不高，一次性投資也不大，而且可節約各種消毒劑，抗菌素，還可以減少換水量，應用臭氧育苗，其成活率至少可提高一倍以上而且一套設備可使用數年，從而既可大大節省養殖成本，又可培育出綠色環保食品，從各個方面講是比較經濟的。目前日本及歐美等大部分***已廣泛采用臭氧進行養殖，并禁止采用氯化物等化學消毒劑進行養殖而造成含氯素過高的產品進入其市場,各大報刊時有報道。

1、淡水養殖中的臭氧殺菌飼育用水的處理模式圖：（臭氧投加量：每立方水投加1～2克）

圖中所示先以 0.1  ～  0.3mg/L濃度處理 5 ～ 10分鐘，再曝氣到臭氧濃度0.003mg/L以下方可用作飼育水